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CCF@U547:李国君走进青岛科技大学

2017-11-07

11月2日下午,“CCF走进高校”活动来到了青岛科技大学。山东省首批泰山学者特聘教授、博士生导师李国君,作了题为“数学在生物医学大数据中的应用”的学术报告。报告由数理学院院长杨树国主持,学院教师、研究生和本科生聆听了本次报告会,会场座无虚席。

李国君从生物数据、精准医学、数据类型和应用案例四个方面展开,阐述了数学在生物医学大数据中的应用。李国君结合自己研究的主要方向,声情并茂地讲解了转录组重构、基因表达数据双聚类和致癌信号通路预测的算法设计,其中详细地讲述了基因芯片数据的双聚类分析,通过种子定位的最优化方法在有向图中寻找最短路,阐释了如何运用数学工具揭示生命的奥秘。他敏锐的洞察力、严谨的逻辑思维能力和渊博的学识,加深了同学们对算法设计的理解,更唤起了到场师生对生物医学大数据的兴趣。会后,李国君就生物信息学的几个具体问题进行了互动答疑。

李国君作报告

学生互动

活动现场座无虚席

听众感言:

李国君教授主要围绕“数学在生物医疗大数据中的应用”这一主题为我们进行讲解。听完报告给我感触最深的无疑是李教授通俗易懂而又不失幽默的讲座风格。首先,李老师介绍了一些常用的生物数据,介绍了目前几种常用的生物数据,让我们对生物数据有一个大致了解,引起我们对生物大数据的兴趣。然后李老师详细介绍了精准医疗的概念。精准医疗本质是通过基因组蛋白质组等组学技术和医学前沿技术,对于大样本人群与特定疾病类型进行生物标记物的分析与鉴定、验证与应用,从而精确寻找到疾病的原因和治疗的靶点,并对一种疾病不同状态和过程进行精确分类,最终实现对于疾病和特定患者进行个性化精准治疗的目的,提高疾病诊治与预防的效益。接着,李老师向大家介绍了常见的生物数据类型,也就是大家构建算法所需要用到的数据,让我们对生物大数据有一个直观的理解,把抽象的生物数据变成我们可以从数学角度处理的数据。最后李老师介绍了他们研究小组在生物大数据方面构建的算法,充分体现理论与实践相结合的原理,让我受益匪浅。

—李珊 统计学专业研三

李教授主要介绍几类生物医学数据以及精准医学给数学和计算机科学带来的机遇和挑战。精准医学刚刚起步,在科技高速发展的今天,我们有超算能力的计算机可以收集海量的数据,不仅给我们带来了机遇,也给医学事业带来重大的挑战。通过李教授的讲解使我对生物数据类型有更进一步的了解,我学习到生物数据类型不仅有基因表达数据,还有组学数据、基因突变数据和网络数据。李教授还介绍生物信息学在新世纪科学领域中的重要地位以及生物信息学对数学科学的迫切需求,用具体的案例说明数学在生物医学数据挖掘中的应用,其中,李教授详细讲解了转录组重构的案例,一个细胞通过捣碎再进行提纯,通过测序进行拼接形成新的转录组数据。他还讲解了基因表达数据双聚类分析,不同类型的双聚类,使得序列更具有生物学意义。我学习到对有序双聚类,存在列置换使得每一行单调,基因表达数据双聚类分析的途径就是种子定位最优化的方法,在有向图中寻找最长路,而且有向图唯一确定的,通过最长的有向路给出最优种子。最后,非常感谢李国军教授做的188体育投注:数学在生物医学大数据方面的详细介绍,让我对生物信息学有了更进一步的认识,通过李教授拓展,让我感受得到生物信息学的魅力。

—邱文莹 统计学专业研二

李国君教授开篇以精准医学这个热点话题吸引了我们所有人的注意力。首先介绍生物数据以及精准医学给人类医学事业带来的重大变革,即从疾病诊断到健康保障,这对人类来说是新的机遇,精准医学把各种现代科技手段集成运用于传统医疗,包括组学的技术,数字影像,系统生物学,信息科学,大数据等等,通过现代科学的手段和传统医学的融合创新,最后成为精准医疗的体系和范式。其次,李教授用通俗易懂的语言,结合形象生动的图片列举了几类生物数据,并讲解了几个案例,内容简明易懂,使我们对生物大数据有了更进一步的了解。最后,李教授介绍了他带领的团队在生物大数据方面所做工作,他们构建了很多算法,取得了巨大成果,这种科研精神是每一个科研人员应该学习的地方!

—吴雪 统计学专业研二

李国君教授的讲座是我进入研究生阶段以来对我影响较大的讲座之一,使我印象深刻,收获也非常大。通过这次讲座,我了解了数学在生物医学大数据的最新发展概况,充实了多方面的知识,拓宽了我的眼界。李国君教授现山东大学二级教授,山东省首批泰山学者特聘教授,博士生导师,主要研究方向是研发算法及开发软件,为生物医学大数据提供有效工具。这次讲座的主题是“数学在生物医学大数据的应用”,李教授主要从生物数据,精准医学,数据类型和应用案例四个方面,进行了精彩的讲解;李教授的讲解条例特别清晰,生动有序,时常举一些例子使道理更加清楚,渗透人心,我们都被深深的吸引住了。李教授还特别讲了他们小组在生物大数据方面构建的双聚类算法。从李教授的精彩讲座中,我还学习到双聚类算法不仅仅用于基因芯片数据分析,还用于生物医学的其他方面。最后,衷心感谢为我们尽心尽力做精彩讲座的李国君教授。这次讲座使我受益匪浅。

—崔晓文 数学专业研一

通过本次CCF走进青岛科技大学,使我对CCF即中国计算机协会有了浓厚的兴趣,很高兴能了解到这样优秀的平台让我们年轻人去交流、去学习、去进步。这次CCF走进青岛科技大学的报告是由李国君教授所讲述的《数学在生物医学大数据中的应用》,在该报告中,李国君教授围绕着这一主题给我们进行了非常精彩、优秀、幽默、耐心的讲解。首先,李老师给我们讲述了几种生物数据,激发了我们对生物数据的兴趣,同时也引发了我们的好奇心,面对一些如此庞大的数据,我们该如何利用它们的有效信息,并且对他们进行挖掘呢?其次,李老师给我们介绍了精准医疗,精准医疗是以个体化医疗为基础、随着基因组测序技术快速进步以及生物信息与大数据科学的交叉应用而发展起来的新型医学概念与医疗模式,同时全世界对于生物医学大数据的利用和发展都是很重视的。接下来,李老师又给我们介绍了以下常用的数据类型,包括:组学数据、基因突变数据和网络数据,通过对数据类型的讲解,可以将生物医学大数据利用数学的思想进行转化,更好的利用数据。最后,李老师讲述他们小组188体育投注:生物医学大数据两个应用案例:转录组重构和基因表达双聚类分析,让我们意识到利用数学工具对生物大数据进行挖掘。本次报告,李国君教授讲解可谓是层次分明、深入浅出,让我获益匪浅。

—禹昭敏 统计学专业研一